Update CNV_in_Ancient_Genomes.tsv

Datasets/CNV_in_Ancient_Genomes.tsv

 Genes	GRCh38/hg38	Denisova 3	Altai Neandertal D5	Chagyrskaya 8	Mezmaiskaya 1	Spy 94a	Vindija 33.19	Mezmaiskaya 2	Les Cottés Z4-1514	Goyet Q56.1	Ust’-Ishim	Peştera Muierii 1	Mal’ta	Loschbour	Motala 12	Stuttgart	Neandertal	H. sapiens
-AMY1A/B/C	3	2.07	1.60	1.36	1.85	2.09	1.03	2.33	2.55	2.26	2.94	3.19	1.65	5.06	2.07	6.10	-	
-SULT1A3/4	2	1.29	1.07	0.98	0.95	0.95	0.88	0.98	0.85	0.86	2.31	2.45	3.35	2.34	1.83	2.47	-	
-SLX1A/B	2	1.28	0.96	0.92	1.02	1.14	0.94	0.93	1.03	1.05	2.19	2.47	3.11	2.34	1.80	2.39	-	
-UGT2B28	1	0.89	0.14	0.12	0.27	0.19	0.17	0.21	0.19	0.14	0.83	0.84	0.35	0.75	0.45	0.46	-	
-LPA	1	1.63	1.38	1.38	1.53	1.89	1.76	2.08	1.86	2.01	1.37	2.08	1.98	1.41	1.39	1.26	+	
-ZNG1E/F/C	3	4.97	4.05	3.51	3.38	4.18	3.52	3.64	4.23	4.16	3.34	4.92	2.21	4.12	3.44	3.56	+	
-ACOT1	1	0.38	0.27	0.27	0.32	0.35	0.38	0.40	0.42	0.31	0.77	0.70	0.84	0.22	0.65	0.77	-	
-CLPS	1	2.20	2.42	2.46	2.77	2.86	3.09	3.59	3.03	3.56	1.36	1.89	3.29	2.65	1.80	2.01	+	+
-CLPSL1	1	1.58	1.64	1.63	1.80	1.63	1.82	2.06	2.18	1.91	1.15	1.58	2.11	1.77	1.51	1.49	+	+
-RFPL4A/L1	2	3.09	2.83	2.88	2.87	2.40		2.57	3.22	2.26	3.84	3.96	3.44	3.60	4.04	2.42	+	+
-F7	1	1.98	2.07	2.03	1.84	1.87	1.75	1.94	1.43	1.91	1.96	1.52	2.08	2.03	2.32	2.27	+	+
-PDX1	1	1.60	1.89	1.88	2.08	1.40	1.48	1.82	2.00	1.51	1.96	1.59	2.03	2.25	2.16	1.91	+	+
-WFS1	1	1.49	1.80	1.74	1.77	1.65	1.49	1.61	1.52	1.76	1.69	1.36	1.84	1.86	1.62	1.98	+	+
-H2AC11	1	1.39	1.65	1.46	1.68	0.18	1.21	2.09	1.73	1.60	1.82	1.60	2.15	1.78	2.15	1.98	+	+
-ACOX3	1	1.38	1.56	1.53	1.55	1.40	1.52	1.43	1.43	1.48	1.51	1.36	1.67	1.75	1.49	1.80		+
-HAND1	1	1.27	1.44	1.31	1.42	0.96	1.46	1.52	1.72	1.61	1.41	1.30	2.15	1.77	1.66	1.51		+
-MST1	1	2.17	2.39	1.94	2.27	2.22	2.14	2.19	2.42	2.34	1.77	1.78	1.54	2.34	2.15	2.24	+	+
-H1-2	1	1.16	1.62	1.38	1.85	1.22	0.80	1.22	1.83	1.09	1.49	1.56	2.26	2.06	2.71	1.83		+
-CD24	1	0.36	0.35	0.25	1.08	0.79	1.10	1.33	1.21	1.30	0.39	0.98	0.58	0.40	0.31	0.39		-
-BOLA2/2B	2	1.03	0.90	0.66	0.95	0.94	0.58	0.90	0.83	0.76	2.01	2.13	4.24	2.22	1.75	1.92	-	
-CLPTM1L	1	1.33	1.52	1.47	1.53	1.58	1.51	1.60	1.58	1.59	1.47	1.30	1.46	1.66	1.59	1.77	+	
-ORM1	1	1.11	2.01	1.85	2.64	1.20	2.22	4.02	2.66	2.39	1.04	0.83	1.09	1.03	1.19	3.45	+	
-ORM2	1	1.12	1.87	1.86	2.67	1.33	1.84	3.68	2.66	2.16	1.05	0.93	0.86	1.07	0.93	1.99	+	
-TPSAB1/B2	2	1.55	1.49	1.33	1.16	1.73	0.90	1.07	1.08	1.26	1.41	1.24	1.17	1.54	1.31	1.53	-	-
-IFNL2/3	2	1.14	1.26	1.17	1.20	1.10	0.92	1.28	1.14	1.40	1.13	1.07	1.26	0.93	1.20	1.19	-	-
-C4A/B	2	3.40	1.46	2.80	2.54	3.27	2.46	2.62	1.83	2.96	2.74	2.63	4.51	3.26	2.81	3.19	+	+
-GRTP1	1	1.5986	1.73	1.83	1.69	1.45	1.65	1.62	1.56	1.62	1.71	1.53	1.56	2.03	1.75	2.04	+	+
-UQCRFS1	1	1.72	1.57	2.46	1.95	2.09	1.45	3.94	2.82	3.37	1.52	1.57	1.38	1.60	1.60	1.58	+	+
-ZNF431	1	1.636	1.65	1.69	1.49	1.69	1.66	1.56	1.62	1.61	1.62	1.64	1.64	1.81	1.56	1.63	+	+
-N4BP3	1	1.35	1.55	1.48	1.64	1.35	1.64	1.55	1.45	1.51	1.52	1.28	1.72	1.62	1.47	1.73	+	+
-STAB1	1	1.42	1.62	1.51	1.65	1.42	1.47	1.52	1.27	1.76	1.48	1.36	1.50	1.67	1.55	1.80	+	+
-LYPD8	1	0.33	0.35	0.32	0.86	0.73	0.83	0.83	0.77	0.77	0.33	0.86	0.36	0.31	0.33	0.30		-
-PECAM1	1	0.36	0.31	0.21	0.87	0.87	0.82	0.86	0.88	0.86	0.32	0.86	0.16	0.32	0.28	0.32		-
-TCAF2	1	0.32	0.27	0.24	0.22	0.22	0.20	0.20	0.25	0.23	0.59	0.60	0.57	0.55	0.55	0.40	-	
-TCAF2C	1	0.53	0.47	0.39	0.39	0.31	0.36	0.36	0.45	0.34	1.13	1.07	1.10	1.02	0.95	0.76	-	
-TMEM86B	1	0.39	0.41	0.38	0.31	0.30	0.41	0.39	0.37	0.29	0.40	0.29	0.47	0.31	0.33	0.40	-	-
-ATP4B	1	1.71	2.15	2.06	1.81	1.64	1.67	1.84	1.46	1.74	1.89	1.66	2.22	2.42	1.97	2.25	+	+
-HGFAC	1	1.49	1.69	1.76	1.63	1.90	1.56	1.60	1.48	1.66	1.71	1.45	1.69	1.73	1.67	2.26	+	+
-SLC9A3	1	1.42	1.62	1.56	1.48	1.81	1.53	1.47	1.49	1.62	1.47	1.36	1.76	1.78	1.56	1.73	+	+
-SEMA3B	1	1.28	1.60	1.49	1.53	1.33	1.79	1.72	1.62	1.89	1.47	1.41	1.40	1.80	1.44	1.89	+	
-NKX6−1	1	1.18	1.41	1.44	1.69	1.50	1.73	1.60	1.62	1.33	1.52	1.28	1.48	1.70	1.70	1.68	+	+
-FGFRL1	1	1.43	1.63	1.51	1.64	1.36	1.59	1.78	1.54	1.68	1.65	1.40	1.72	1.71	1.59	2.07	+	+
-DRD5	1	1.60	1.77	1.80	2.02	2.33	1.84	1.62	1.59	1.26	1.77	1.60	2.01	2.02	1.66	1.76	+	+
-IDUA	1	1.52	1.74	1.76	1.79	1.68	1.96	1.75	1.57	1.81	1.73	1.57	1.91	1.81	1.73	2.09	+	+
-ATP5ME	1	1.38	1.60	1.62	1.81	1.87	1.77	1.51	1.85	1.62	1.64	1.66	2.30	1.89	1.45	1.90	+	+
-H4C5/16	2	2.14	2.23	1.89	2.24	1.62	1.84	1.89	2.30	2.18	2.57	2.05	3.78	2.38	2.63	2.67		+
-IFRD2	1	1.25	1.51	1.23	1.71	0.98	1.35	1.37	1.20	1.73	1.38	1.23	1.81	1.54	1.50	1.70		+
-IER3 (IEX-1)	1	1.41	1.65	1.49	0.85	0.49	1.01	1.39	1.31	1.12	1.56	1.38	3.23	1.87	1.23	1.82		+
-HAND2	1	1.24	1.47	1.49	1.61	1.38	1.62	1.55	1.41	1.55	1.58	1.30	1.59	1.80	1.49	1.61		+
-PLXND1	1	1.25	1.46	1.43	1.56	1.27	1.47	1.45	1.36	1.49	1.39	1.25	1.51	1.55	1.53	1.70		+
+AMY1A/B/C	3	1.58	1.6	1.36	1.85	2.09	1.36	2.33	2.55	2.26	2.94	3.19	1.65	5.06	2.07	6.1	-	
+SULT1A3/4	2	1.04	1.07	0.98	0.95	0.95	1.01	0.98	0.85	0.86	2.31	2.45	3.35	2.34	1.83	2.47	-	
+SLX1A/B	2	1.03	0.96	0.92	1.02	1.14	0.99	0.93	1.03	1.05	2.19	2.47	3.11	2.34	1.8	2.39	-	
+UGT2B28	1	0.82	0.14	0.12	0.27	0.19	0.17	0.21	0.19	0.14	0.83	0.84	0.35	0.75	0.45	0.46	-	
+LPA	1	1.42	1.38	1.38	1.53	1.89	1.47	2.08	1.86	2.01	1.37	2.08	1.98	1.41	1.39	1.26	+	
+ZNG1E/F/C	3	3.92	4.05	3.51	3.38	4.18	3.67	3.64	4.23	4.16	3.34	4.92	2.21	4.12	3.44	3.56	+	
+ACOT1	1	0.28	0.27	0.27	0.32	0.35	0.35	0.4	0.42	0.31	0.77	0.7	0.84	0.22	0.65	0.77	-	
+CLPS	1	2.31	2.42	2.46	2.77	2.86	2.65	3.59	3.03	3.56	1.36	1.89	3.29	2.65	1.8	2.01	+	+
+CLPSL1	1	1.58	1.64	1.63	1.8	1.63	1.75	2.06	2.18	1.91	1.15	1.58	2.11	1.77	1.51	1.49	+	+
+RFPL4A/L1	2	2.94	2.83	2.88	2.87	2.4	2.75	2.57	3.22	2.26	3.84	3.96	3.44	3.6	4.04	2.42	+	+
+F7	1	1.93	2.07	2.03	1.84	1.87	1.84	1.94	1.43	1.91	1.96	1.52	2.08	2.03	2.32	2.27	+	+
+PDX1	1	1.71	1.89	1.88	2.08	1.4	1.97	1.82	2	1.51	1.96	1.59	2.03	2.25	2.16	1.91	+	+
+WFS1	1	1.59	1.8	1.74	1.77	1.65	1.69	1.61	1.52	1.76	1.69	1.36	1.84	1.86	1.62	1.98	+	+
+H2AC11	1	1.52	1.65	1.46	1.68	0.18	1.7	2.09	1.73	1.6	1.82	1.6	2.15	1.78	2.15	1.98	+	+
+ACOX3	1	1.43	1.56	1.53	1.55	1.4	1.56	1.43	1.43	1.48	1.51	1.36	1.67	1.75	1.49	1.8		+
+HAND1	1	1.37	1.44	1.31	1.42	0.96	1.41	1.52	1.72	1.61	1.41	1.3	2.15	1.77	1.66	1.51		+
+MST1	1	1.99	2.39	1.94	2.27	2.22	1.97	2.19	2.42	2.34	1.77	1.78	1.54	2.34	2.15	2.24	+	+
+H1-2	1	1.25	1.62	1.38	1.85	1.22	1.61	1.22	1.83	1.09	1.49	1.56	2.26	2.06	2.71	1.83		+
+CD24	1	1.11	0.35	0.25	1.08	0.79	0.25	1.33	1.21	1.3	0.39	0.98	0.58	0.4	0.31	0.39		-
+BOLA2/2B	2	0.83	0.9	0.66	0.95	0.94	0.76	0.9	0.83	0.76	2.01	2.13	4.24	2.22	1.75	1.92	-	
+CLPTM1L	1	1.37	1.52	1.47	1.53	1.58	1.51	1.6	1.58	1.59	1.47	1.3	1.46	1.66	1.59	1.77	+	
+ORM1	1	1.05	2.01	1.85	2.64	1.2	1.72	4.02	2.66	2.39	1.04	0.83	1.09	1.03	1.19	3.45	+	
+ORM2	1	1.05	1.87	1.86	2.67	1.33	1.78	3.68	2.66	2.16	1.05	0.93	0.86	1.07	0.93	1.99	+	
+TPSAB1/B2	2	1.32	1.49	1.33	1.16	1.73	1.33	1.07	1.08	1.26	1.41	1.24	1.17	1.54	1.31	1.53	-	-
+IFNL2/3	2	1.14	1.26	1.17	1.2	1.1	1.11	1.28	1.14	1.4	1.13	1.07	1.26	0.93	1.2	1.19	-	-
+C4A/B	2	2.86	1.46	2.8	2.54	3.27	2.73	2.62	1.83	2.96	2.74	2.63	4.51	3.26	2.81	3.19	+	+
+GRTP1	1	1.57	1.73	1.83	1.69	1.45	1.77	1.62	1.56	1.62	1.71	1.53	1.56	2.03	1.75	2.04	+	+
+UQCRFS1	1	1.62	1.57	2.46	1.95	2.09	1.46	3.94	2.82	3.37	1.52	1.57	1.38	1.6	1.6	1.58	+	+
+ZNF431	1	1.63	1.65	1.69	1.49	1.69	1.63	1.56	1.62	1.61	1.62	1.64	1.64	1.81	1.56	1.63	+	+
+N4BP3	1	1.45	1.55	1.48	1.64	1.35	1.6	1.55	1.45	1.51	1.52	1.28	1.72	1.62	1.47	1.73	+	+
+STAB1	1	1.49	1.62	1.51	1.65	1.42	1.53	1.52	1.27	1.76	1.48	1.36	1.5	1.67	1.55	1.8	+	+
+LYPD8	1	0.87	0.35	0.32	0.86	0.73	0.31	0.83	0.77	0.77	0.33	0.86	0.36	0.31	0.33	0.3		-
+PECAM1	1	0.89	0.31	0.21	0.87	0.87	0.24	0.86	0.88	0.86	0.32	0.86	0.16	0.32	0.28	0.32		-
+TCAF2	1	0.26	0.27	0.24	0.22	0.22	0.25	0.2	0.25	0.23	0.59	0.6	0.57	0.55	0.55	0.4	-	
+TCAF2C	1	0.4	0.47	0.39	0.39	0.31	0.39	0.36	0.45	0.34	1.13	1.07	1.1	1.02	0.95	0.76	-	
+TMEM86B	1	0.42	0.41	0.38	0.31	0.3	0.39	0.39	0.37	0.29	0.4	0.29	0.47	0.31	0.33	0.4	-	-
+ATP4B	1	1.74	2.15	2.06	1.81	1.64	1.95	1.84	1.46	1.74	1.89	1.66	2.22	2.42	1.97	2.25	+	+
+HGFAC	1	1.56	1.69	1.76	1.63	1.9	1.68	1.6	1.48	1.66	1.71	1.45	1.69	1.73	1.67	2.26	+	+
+SLC9A3	1	1.49	1.62	1.56	1.48	1.81	1.62	1.47	1.49	1.62	1.47	1.36	1.76	1.78	1.56	1.73	+	+
+SEMA3B	1	1.36	1.6	1.49	1.53	1.33	1.62	1.72	1.62	1.89	1.47	1.41	1.4	1.8	1.44	1.89	+	
+NKX6−1	1	1.25	1.41	1.44	1.69	1.5	1.61	1.6	1.62	1.33	1.52	1.28	1.48	1.7	1.7	1.68	+	+
+FGFRL1	1	1.53	1.63	1.51	1.64	1.36	1.75	1.78	1.54	1.68	1.65	1.4	1.72	1.71	1.59	2.07	+	+
+DRD5	1	1.62	1.77	1.8	2.02	2.33	1.82	1.62	1.59	1.26	1.77	1.6	2.01	2.02	1.66	1.76	+	+
+IDUA	1	1.58	1.74	1.76	1.79	1.68	1.79	1.75	1.57	1.81	1.73	1.57	1.91	1.81	1.73	2.09	+	+
+ATP5ME	1	1.42	1.6	1.62	1.81	1.87	1.71	1.51	1.85	1.62	1.64	1.66	2.3	1.89	1.45	1.9	+	+
+H4C5/16	2	2.27	2.23	1.89	2.24	1.62	2.49	1.89	2.3	2.18	2.57	2.05	3.78	2.38	2.63	2.67		+
+IFRD2	1	1.32	1.51	1.23	1.71	0.98	1.52	1.37	1.2	1.73	1.38	1.23	1.81	1.54	1.5	1.7		+
+IER3 (IEX-1)	1	1.5	1.65	1.49	0.85	0.49	1.75	1.39	1.31	1.12	1.56	1.38	3.23	1.87	1.23	1.82		+
+HAND2	1	1.4	1.47	1.49	1.61	1.38	1.69	1.55	1.41	1.55	1.58	1.3	1.59	1.8	1.49	1.61		+
+PLXND1	1	1.34	1.46	1.43	1.56	1.27	1.42	1.45	1.36	1.49	1.39	1.25	1.51	1.55	1.53	1.7		+
\ No newline at end of file